由醫師採檢，不需加抗凝劑，分成無菌管3管，第一支試管CSF用於化學及免疫學分析，檢體冷藏(2~8℃)；第二支試管CSF用於微生物學檢查，注意不能將第二支放置冷藏，會使Neisseria沒辦法培養；第三支試管CSF用於細胞計數及分類，檢體冷藏(2~8℃)。

CSF檢體採集後應儘快送檢，因細胞在檢體採集後一小時會開始溶解，在冷藏的情況可保存四小時。且應註明採檢時間，並請配合在一小時內送達報告的正確性最高。無法在1小時到達實驗室時，請在報告的註解處說明”檢體時間>1hr，採檢時間；收檢時間，是否超過四小時 ”，檢體量至少2 ml。

CSF檢體同時有CSF Routine及微生物檢查時，請分裝2管檢體。請注意用於微生物培養的CSF應室溫保存。

檢體退件：檢體clot，但如檢體無法重複取得，需以該檢體經標準檢驗程序檢測後，於Clarity欄位報告：部分檢體clot，檢驗數據僅供參考

CSF分析可提供重要的診斷訊息包括：腦膜炎、神經性梅毒、腦膿腫、蜘蛛膜下腔出血、多發性硬皮症、脊髓腫瘤等。

相關的檢查包括Routine、Culture、Fungi Culture、Cytology、Oligo-bands、Cryptococcus antigen、India Ink，Routine的檢查主要用在分別腦膜炎的成因。